小兒呼吸系統由于生長發育的原因，與成人在解剖和生理方面均有著較為明顯的差別，其中一些還成為小兒呼吸道疾病的解剖生理基礎其特點為：
    呼吸系統包括上呼吸道、下呼吸道及肺三個部分。鼻、咽和喉為上呼吸道；而下呼吸道則由氣管、支氣管及其在肺內的分支組成；肺作為一個獨立的呼吸器官，在氣體的交換方面扮演著及其重要的角色。另外，肺門結構和呼吸肌對于肺的營養、氣體交換、輔助完成呼吸動作，尤其是深呼吸方面，都有其不可替代的作用。
    一、鼻　由于面部顱骨發育不全，小兒的鼻及鼻腔相對的短小。以后，隨著顱骨的發育以及出牙，鼻道逐漸加大加寬。嬰幼兒沒有鼻毛，鼻粘膜柔弱且富于血管，故易受感染，而且感染時由于鼻粘膜的腫脹，使鼻腔更加狹窄，甚至閉塞，發生呼吸困難。這就解釋了為什么嬰兒在普通感冒時，也會發生呼吸困難，拒絕吃奶以及煩躁不安。鼻淚管在年幼兒較短，開口部的瓣膜發育不全，位于眼的內眥，所以小兒上呼吸道感染往往侵及結膜。
    二、鼻咽部及咽部　嬰兒鼻咽及咽部相對的狹小，且較垂直。咽鼓管較寬，短而且直，呈水平位，因此嬰幼兒患感冒后易并發中耳炎。咽后壁有顆粒形的淋巴濾泡，一周歲內最顯著，以后逐漸萎縮；而扁桃體則需要到一歲末才逐漸長大，４～10歲時發育達最高峰，14～15歲時又逐漸退化。因此嬰兒易發生咽后壁膿腫，而學齡期兒童則易患扁桃體炎，而且當細菌藏于腺窩深處時易引發慢性感染及急性腎炎等與免疫有關的疾病。
    三、喉　小兒的喉相對較成人長，喉腔較窄，粘膜薄弱而富于血管及淋巴組織，因此輕微的炎癥即可引起喉頭狹窄，引起呼吸困難甚至窒息，需緊急處理。
    四、氣管、支氣管　嬰幼兒氣管較短，右側支氣管較直，有點象氣管的延續，因此氣管插管較易滑入右側，支氣管異物也以右側多見。嬰兒氣管壁較薄，管壁平滑肌不發達，細支氣管無軟骨，故容易受壓而致通氣障礙，尤其在伴有支氣管痙攣、粘膜腫脹及分泌物堵塞等因素時更加明顯。
    五、肺　作為一個獨立的呼吸器官，肺在氣體交換方面有著不可替代的作用。小兒時期肺的基本組成單位與成人大致相同，但肺泡之間的kohn孔要到兩歲以后才能出現，所以嬰兒無側枝通氣。
    六、肺門　肺門包括大支氣管、進出肺的血管和大量的淋巴結。肺門淋巴結與肺臟其它部位的淋巴結互相聯系。因此肺部各種炎癥均可引起肺門淋巴結的反應。部分肺門淋巴結伸入兩肺的大裂隙，故有時感染由此而入，可引起胸膜炎。肺間質氣腫時氣體可經過肺門進入縱隔，形成縱隔氣腫。
    七、呼吸肌　呼吸肌是呼吸的動力。嬰兒胸部呼吸肌不發達，主要靠膈呼吸，易受腹脹等因素影響。同時在已有的呼吸肌之中，耐疲勞的肌纖維只占少數，故小嬰兒呼吸肌易于疲勞，成為導致呼吸衰竭的重要因素。