徐州市兒童醫院感染性疾病一科是徐州市衛計委指定的市區唯一收治手足口病科室，同時也收治徐州市六縣一區以及安徽、山東、河南等徐州周邊地區轉診的重癥手足口病患兒。徐州市兒童醫院感染性疾病科一科手足口病診療技術在徐州以及周邊地區一直處于領先地位。本科室自成立以來，在手足口病的診斷與鑒別診斷，以及重癥手足口病的早期識別、阻斷病情加重以及救治方面積累了大量經驗，成功救治大量重癥手足口病患兒，未發生一例手足口病患兒死亡。本科室同時還收治其他感染性疾病，在重癥感染、膿毒血癥、不明原因發熱等疾病診療方面積累了大量經驗。

徐州市兒童醫院感染性疾病科一科目前設有專科門診、專家門診，病房編制床位68張，實際開放床位68張。醫護人員高、中、初級人才結構合理，擁有碩士研究生3名，在讀碩士研究生5名。